该算法可以估算8种免疫细胞（cd3 + t细胞，cd8 + t细胞，细胞毒性淋巴细胞，nk细胞，b淋巴细胞，单核细胞，髓样树突状细胞，中性粒细胞）和2种基质细胞（成纤维细胞和内皮细胞）的丰度。

2021年9月29日 · cibersort 是非常常用的一个计算免疫细胞浸润的方法，它利用线性支持向量回归的原理对免疫细胞亚型的表达矩阵进行去卷积，来估计免疫细胞的丰度。 CIBERSORT 提供了 22 种常见的免疫浸润细胞表达数据 LM22，包括不同的细胞类型和功能状态的免疫细胞。

说到肿瘤免疫浸润，就不得不提肿瘤微环境（Tumor microenvironment，TME）。 肿瘤微环境，是一个复杂的网络。 细胞成分包括：肿瘤细胞、基质细胞（成纤维细胞、脂肪细胞、神经和神经内分泌（NE）细胞、内皮细胞（E…

为了准确的评估 肿瘤微环境 中免疫细胞的构成，我们可以通过很多方法从 RNA 测序数据中量化肿瘤浸润的免疫细胞，比如 ssGSEA, Cibersoft, TIMER, EPIC 等. 这些方法大体包括两个思想，一个是 marker gene ，还有一个是反卷积思想。

18 免疫浸润分析 在本章节中，将详细探讨免疫细胞的组成结构、其在不同个体和分组之间的相对丰度差异，并通过热图等可视化手段，对这些差异进行直观而深入的解析。

2024年8月17日 · 免疫浸润是指免疫细胞如淋巴细胞、浆细胞、巨噬细胞等进入到组织或器官中，并在这些组织或器官中发挥免疫功能的过程。 免疫 细胞的 浸润 可以是炎症反应的一部分，也可以是针对感染、肿瘤或其他疾病的 免疫 应答的一部分。

ESTIMATE（Estimation of STromal and Immune cells in MAlignant Tumor tissues using Expression data）算法，利用预筛选的基质/免疫相关基因集，使用基因表达数据预测肿瘤组织中基质/免疫细胞浸润水平，可以生成三个分数： 基质评分 （stromal score），评估肿瘤组织中的基质 …

2022年2月7日 · 什么是免疫浸润细胞？ 肿瘤浸润淋巴细胞（英语：Tumor-infiltrating lymphocytes，缩写TILs）是指已离开血液向肿瘤组织迁移的淋巴细胞，是肿瘤浸润免疫细胞（英语：tumor-infiltrating immune cells）这个更大的概念的一部分，后者还包括单核细胞和分叶核的免 …

2023年5月15日 · 这些肿瘤免疫浸润细胞的具体作用是怎样的呢？ 据报道，免疫细胞具有双重作用， 一方面，免疫细胞在采取抗肿瘤表型时，可以起到免疫监视作用，阻止肿瘤进展;另一方面，免疫细胞在TME的影响下，可以采取促肿瘤表型，允许肿瘤逃逸，甚至支持TME，从而促进 ...

为了帮助研究人员探索这一领域，我们创建了一份表型指南，以鉴定迄今为止已知对肿瘤免疫应答影响最大的免疫细胞。 例子包括 CD8 T 细胞，在抗原递呈到 CD8 T 细胞方面表现出色的树突状细胞（交叉递呈），以及上述的免疫抑制细胞类型。